Сложный рельеф республики обусловливает разнообразие растительного покрова. Флора Узбекистана насчитывает свыше 3700 видов растений. Не менее 20% видов - эндемики, т.е. больше нигде не встречаются; большая часть их произрастает в горах. Особенно интересна флора степей и пустынь, состоящая из немногих, но своеобразных кустарников. Разбросанные по барханам, полу засыпанные песком, корявые, узловатые изогнутые и изломанные ветром, с мелкими листьями или совсем безлистные, представляют своего рода степной, но лес без тени и прохлады.

Скрепляя многометровыми корнями песчаную почву, степные заросли препятствуют выдуванию ее ветром и образованию сыпучих подвижных песков. Из 400 видов растений, известных на плато Устюрт, лишь несколько играют существенную роль ландшафте. Это ежовник солончаковый, полынь бело-земельная и раскидистая, солянка восточная. По всему плато встречается саксаул кыгровый. В отдельные годы, с предшествующей влажной и теплой осенью, на больших массивах развивается обильный покров из эфемеров.

Злостные солончаки, богатые вредными для растений солями, почти лишены растительности, за исключением таких, как чёрный саксаул. Дерево быстрорастущие и недолговечное. Это ценнейшее растение, в прошлом -топливо, теперь используется в основном для закрепления песков. Плоды и молодые веточки саксаула служат кормом для овец и верблюдов.

Растения пустынь хорошо приспособлены к длительной засухе, перегреву, подвижным или засоленным и всегда бедным грунтам. Широко распространены такие приспособления, как безлистность, уменьшающая испарение (саксаул, джузгун и др.), быстрое ускорение, уход в спячку во время жары (луковичные и клубневые) На низких равнинах речные долины особенно широки. Здесь развита древесная, кустарниковая, травянистая растительность. Для тугаев характерны заросли тростника и кендыря.

В ландшафте подгорных равнин – травы, деревьев нет, кустарники встречаются лишь по временным водотоком. Кроме некоторых злаковых, здесь развиваются различные виды лука, тюльпаны, ревень, ирисы и целая масса иных сочных и нередко красиво цветущих форм, которые под палящими лучами солнца быстро засыхают, рассыпаясь в пыль и уступая место полыни и другим более грубым растениям, приспособленным к жаре.

В низком предгорье, или горной полупустыне наибольшее число видов эфемеров, на 1 м2 15-20 видов. Высокое предгорье – это сухая разнотравная степь на темных сероземах. На каменистых участках развиваются либо кустарники – миндаль, курчавка, вишарник, либо нагорные ксерофиты – виды акатолимона, астрогал.

Низкогорье – это лесные угодья, но древесные насаждения сохранились только на небольших участках, непригодных для земледелия или труднодоступных местах. В основном растет ксерофильная арча зеравшанская – ценнейшая древесная порода. Арча растёт медленно, но долговечна. Известны тысячелетние растения.

Особенно богато низкогорье кустарниками: жимолость, барбарис, шиповник, таволга; изредка встречаются небольшие заросли дикого винограда, лозы которого поднимаются по тополям и другим деревьям или распластаны по камням.

Очень разнообразен набор трав, много эфирномасличных: шалфей мускатный, зизифора, дубильных: ревень, щавель. Много тюльпанов, эремурусов. Оазисы республики богаты культурной растительностью, прежде всего это хлопчатник. Из злаков, кроме пшеницы и ячменя, культивируется рис, особенно в низовьях Амударьи. Издавна в Узбекистане выращиваются различные фрукты, овощи, бахчевые.